再话大数据与精准医学

作者：枫叶松木木

现在，大数据与精准医学依然在“热销”中，尽管并不是所有的人都持积极的态度，也尽管依然不少项目在遭遇挫折，但仍然有不少前仆后继者。是的，历史证明，一项新的技术正真落地需要千锤百炼!另外，很多事情也不是单靠热情和金钱就能搞好的，有很多案例：有资金实力的机构紧跟潮流并急于求成，投入了不少的资金和人力转向热门领域搞了多年，也未能取得很大成效。实际上，我们还需要更多的毅力、时间、人才、智慧和奋斗，才可能成功。

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话归正题，我们先来回顾一下近期的相关信息。

健康大数据与基因数据应用

随着有关研究人员努力整合来自健康档案、基因组和其他生理数据的临床试验数据，广大患者正在做出越来越多的贡献。可穿戴设备，如智能手机和FitBits正在收集有关运动与心率数据，而这样的数据量也还在不断攀升，因为收集这种数据越来越简易可行，每个患者都可能成为一个大数据生产者，我们在家里或者公共场所收集的健康数据将会大大超过我们所积累的临床数据。我们正在努力收集不同模式的数据，从基因组到临床医学环境，然后将其链接到具体的病人身上。进一步地，我们可以利用碎片化的计算方式使得今日我们的大数据计算就像袖珍计算机问题一样简单。随着科学家想方设法地整合碎片化数据，广大患者将是最终的获益者。

当前，我们收集并维护这些丰富的基因组信息，是为了解释基因突变对于个体生理健康的影响，其中较早一个实践的是病理学。临床药理学联盟已经将药物-基因关联，基于PharmGKB数据库，投入实施并用于临床使用。比方说，带有某种基因突变的个体将会对特定的抗凝剂产生很差的反应效果，从而导致心脏病发作的可能性增加。其实，将健康维护与基因发现如何更好地结合起来，仍然是人类面对的一个问题，完成这个过程需要我们投入更多的时间和精力。从研究的角度看，结合基因型与表现型信息给我们带来了累累硕果。大部分疾病相关基因变异是通过全基因组关联研究而鉴别得来的，在这个研究过程中，大量的患有某种疾病的个体参与了相关检测，以确定遗传特征识别。研究人员现在可以从健康记录反向工作，以确定什么临床表现是与给定的基因变异密切相关的。科学家们甚至正致力于分析百万人群计划的基因组信息，其中包括蛋白质组，转录组以及代谢组等等，并计划应用人工智能来探索这个领域的大数据。

以上这些是有关健康大数据与基因数据方面的应用。接下来，我们再来关注一下近期精准医学的应用进展。

基因研究与基因治疗

1. 我们先看一看有关基因治疗的积极案例。

荷兰著名基因疗法开发商UniQure公司，最近公布了一项先行实验的积极数据，将有助于其罕见病疗法AMT-110的进一步开发。AMT-110是一种用于治疗罕见病Sanfilippo B syndrome的基因疗法。Sanfilippo B syndrome是由于儿童体内一种名为NaGlu蛋白的缺失而导致的致死性疾病。在这项先行实验中，四名患者接受了单一剂量的AMT-110，结果发现其体内的NaGlu水平在治疗三个月后上升了17%之多，更令UniQure研究人员振奋的是这一效果在12个月后依然存在。这也是UniQure公司首次公布AMT-110的相关数据，此前研究表明如果能将Sanfilippo B syndrome患者体内的NaGlu水平提高5%-10%，即可大大延长患者的生存期和提高他们的生活质量。据此，UniQure公司计划进一步开展关于AMT-110更近一步的临床研究。

2015年10月，基因治疗公司Spark Therapeutics在揭晓了对一种致盲性罕见遗传病的基因治疗临床后期试验研究的正性结果之后，实验性基因治疗帮助改善了患者的视力，使得把它变成为美国第一个批准上市的基因治疗药物又向前推进了一步，股票暴涨高达50.2%。这家在费城起家的药物开发公司称，其领先的药物SPK-RPE65，目标是改善遗传性视网膜营养不良视力(IRD)患者的视力和对光线敏感性，目前产品达到了III期临床研究的主要目标，显示了功能性视力的改善。参与该研究的一位研究人员在Spark Therapeutics公司的一份声明中说到，科学家们看到了“朝着完全失明状况发展的患者的视力得到了实质性恢复”。SPK-RPE65是一种基因治疗，治疗旨在插入正确的基因进入缺陷的细胞。该研究测试了这种基因药物在31例IRDs患者的治疗作用。IRD是一大类影响视网膜的遗传性疾病。

以上是基因治疗在罕见病临床方面取得的进展。

2. 我们再来看一看基因治疗的负面案例。

最近，基因疗法的先驱Bluebird生物医药公司在美国血液病学会会议上公布了其基因疗法LentiGlobin BB305的最新临床研究结果。研究人员发现BB305疗法在一些带有β-球蛋白基因缺陷患者群体中未能表现出显着性差异。β-球蛋白基因缺陷会使得患者不能产生足够的血红蛋白，从而引起严重的贫血症。此次研究的适应症β-地中海贫血,被划分为两个关键患者群体：即能产生少量球蛋白患者群体和未能产生球蛋白患者群体。几个月前公布的数据已经证明这一疗法对后者疗效并不明显，这些患者在6-18月之后仍然要接受输血治疗。

这一结果促使该公司不得不调整了BB305的研究计划，并将该疗法的适应症群体放在症状较轻的地中海贫血患者中。曾几何时，凭借基因疗法的光环，Bluebird公司股价被炒至194美元之多，而BB305也被认为可以在镰刀型红细胞贫血中发挥作用。如今随着BB305一系列数据的公布，公司股价已经被腰斩。事实上，最近一段时间基因疗法接连受挫。在最近，另一个基因疗法先驱UniQure决定放弃其基因疗法Glybera在美国上市的决定。如今，Bluebird公司的遭遇无疑使基因疗法更加雪上加霜。或许，这种极具前景的疗法还需要克服不少困难才能真正涅盘重生，成为医疗产业的新星。

基因治疗在临床中历经起伏。多年前基因治疗因为危及生命安全问题而搁浅。但之后一些主要研究者认为，他们已经学会了如何开发安全有效的传递工具来修复基因，从而治疗疾病或长期修复病症。基因疗法在近年来已经从假想逐渐变成了现实。然而，这一疗法经历的起起伏伏，让人不禁为其前景打上了一个大大的问号。Bluebird公司公布了基因疗法LentiGlobin BB305的最新临床研究结果。然而，这一结果未能达到预期，使公司股价遭受重创，基因疗法的前景蒙上了一层阴云。肿瘤免疫、基因治疗都是工具技术与平台型公司结合之后，在疾病领域的重大突破，

3. 最后，基因应用公司仍在火拼

药物开发的III 期临床研究，通常是一个公司将其治疗方案提交给监管机构批准的最后阶段。Spark Therapeutics公司表示，它计划这项治疗IRD的药物SPK-RPE65在2016年能获得美国食品和药物管理局批准。虽然目前没有针对IRD被批准的治疗，但是这些结果使Spark Therapeutics公司轻松地超越了对手一步，包括应用基因技术公司，Avalanche生物技术公司和ReGenxbio公司。这些公司也开始了他们自己的对于眼病的治疗研究。

Dimension Therapeutics公司研究的药物主要针对血友病。去年6月，Dimension Therapeutics公司作出一系列举措，不断推进基因治疗疗法，并与拜耳公司签订了一项总价值约2.5亿美元的协议。根据这一协议，拜耳公司将资助Dimension公司开发的治疗A型血友病的所有临床前研究以及随后的前期临床研究。一旦获得成功，拜耳公司将负责最后的临床上三期研究，并将获得这种疗法的全球商业权利。而Dimension公司将会保留B型血友病疗法的所有权。

同时，最近辉瑞公司支付给Spark 2000万美元预付款获得SPK-FIX，一些用于需要修复血友病B基因的治疗项目之一，这种基因治疗方法被广泛认为是重要的下一代方法，相比目前使用的血友病药物有显著的改善。而像SPK-RPE65，Spark计划使用AAV传递介质为患者提供基因治疗。

另一方面，UniQure公司一直以来都致力于基因疗法在中枢神经系统疾病领域的开发应用。此次AMT-110的积极数据将进一步推动公司在这一领域中的发展。作为基因疗法领域的先驱者之一，UniQure公司目前在多个疾病领域中都有自己的产品开发计划。公司目前进度最快的产品Glybera目前已经完成了一项临床三期研究，FDA此前曾要求公司再进行另外一次三期研究以帮助FDA做出最后的决定。此外，公司还在血友病以及帕金森症等方面都有条不紊的进行研究。

精准医学任重道远

从上面信息中我们可以看到，精准医学的临床应用尚面临诸多挑战，从技术上还需要不断改进和完善。例如，基因疗法在治疗罕见病方面的结果也是令人悲喜交加。不仅如此，用于治疗复杂疾病的基因疗法的价格，可能也会达到非常高的水平。但投资者非常看好开发这种疗法的公司。今年1月份，以治疗眼疾为目标的生物技术公司Spark Therapeutics在上市首日的市值就已经达到了12亿美元。UniQure研发的药物Glybera用于治疗脂蛋白脂肪酶缺乏症，这种疗法在去年11月份上市，其价格高达每名病人110万欧元(约合120万美元)，目标是那些缺少蛋白质以分解脂肪分子的患者。

目前，即使基因治疗的效果达到了很高的水平，但从经济上还不太可能全面普及，因为有些基因疗法实在是太昂贵了，不是每个患者都能承担的。基因疗法只有在技术上的可靠性、疗效的显著性和经济上的可接受性三者俱佳的情况下，才能真正走向成熟，才能真正广泛应用于临床。精准医学任重道远!

via:blog.sina

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