利用R语言进行交互数据可视化
作者:谢佳标
上周在中国R语言大会北京会场上,给大家分享了如何利用R语言交互数据可视化。现场同学对这块内容颇有兴趣,故今天把一些常用的交互可视化的R包搬出来与大家分享。
rCharts包
说起R语言的交互包,第一个想到的应该就是rCharts包。该包直接在R中生成基于D3的Web界面。
rCharts包的安装 36大数据(http://www.36dsj.com/)
rCharts函数就像lattice函数一样,通过formula、data指定数据源和绘图方式,并通过type指定图表类型。
下面通过例子来了解下其工作原理。我们以鸢尾花数据集为例,首先通过name函数对列名进行重新赋值(去掉单词间的点),然后利用rPlot函数绘制散点图(type=”point”),并利用颜色进行分组(color=”Species”)。
rCharts支持多个javascript图表库,每个都有自己的长处。每一个图表库有多个定制选项,其中大部分rCharts都支持。 36大数据(http://www.36dsj.com/)
NVD3 是一个旨在建立可复用的图表和组件的 d3.js 项目——它提供了同样强大的功能,但更容易使用。它可以让我们处理复杂的数据集来创建更高级的可视化。在rCharts包中提供了nPlot函数来实现。
下面以眼睛和头发颜色的数据(HairEyeColor)为例说明nPlot绘图的基本原理。我们按照眼睛的颜色进行分组(group=”eye”),对头发颜色人数绘制柱状图,并将类型设置为柱状图组合方式(type=”multiBarChart”),这样可以实现分组和叠加效果。
可以通过图形右上角选择需要查看或隐藏的类别(默认是全部类别显示的),也能通过左上角选择柱子是按照分组还是叠加的方式进行摆放(默认是分组方式)。如果选择Stacked,就会绘制叠加柱状图。
Highcharts是一个制作图表的纯Javascript类库,支持大部分的图表类型:直线图,曲线图、区域图、区域曲线图、柱状图、饼状图、散布图等。在rCharts包中提供了hPlot函数来实现。
以MASS包中的学生调查数据集survery为例,说明hPlot绘图的基本原理。我们绘制学生身高和每分钟脉搏跳动次数的气泡图,以年龄变量作为调整气泡大小的变量。
rCharts包可以画出更多漂亮的交互图, http://ramnathv.github.io/rCharts/ 和 https://github.com/ramnathv/rCharts/tree/master/demo 有更多的例子可供大家学习。
recharts包 36大数据(http://www.36dsj.com/)
学习完rCharts包,可能有读者会问,我们有没有国人开发的包实现相似的效果呢?这边给大家推荐一个同样功能强大的recharts包。
本包来源于百度开发的国内顶尖水平的开源d3-js可视项目Echarts(Github Repo)。Yang Zhou和Taiyun Wei基于该工具开发了recharts包,经Yihui Xie修改后,可通过htmlwidgets传递js参数,大大简化了开发难度。但此包开发仍未完成。为了赶紧上手用,基于该包做了一个函数echartR(下载至本地,以后通过source命令加载),用于制作基础Echart交互图。需要R版本>=3.2.0.
安装方式如下: 36大数据(http://www.36dsj.com/)
安装完后,需要在 https://github.com/madlogos/recharts/blob/master/R/echartR.R 将echartR.R脚本下载到本地。
假如想对鸢尾花数据集绘制散点图,可以执行如下代码: 36大数据(http://www.36dsj.com/)
绘制柱状图: 36大数据(http://www.36dsj.com/)
玫瑰图:
雷达图: 36大数据(http://www.36dsj.com/)
plotly包
接下来要给大家介绍的是另一个功能强大的plotly包。它是一个基于浏览器的交互式图表库,它建立在开源的JavaScript图表库plotly.js之上。
有两种安装方式: 36大数据(http://www.36dsj.com/)
或者 36大数据(http://www.36dsj.com/)
plotly包利用函数plot_ly函数绘制交互图。
如果相对鸢尾花数据集绘制散点图,需要将mode参数设置为”markers”。
如果想绘制交互箱线图,需要将type参数设置为box。
如果你已熟悉ggplot2的绘图系统,也可以针对ggplot2绘制的对象p,利用ggplotly函数实现交互效果。例如我们想对ggplot绘制的密度图实现交互效果,执行以下代码即可。
其他
此外还有很多好玩有用的交互包。例如专门用来画交互时序图的dygraphs包,可通过install.packages(“dygraphs”)安装。
DT包实现R数据对象可以在HTML页面中实现过滤、分页、排序以及其他许多功能。通过install.packages(“DT”)安装。
以鸢尾花数据集iris为例,执行以下代码:
networkD3包可实现D3 JavaScript的网络图,通过install.packages(“networkD3”)安装。
下面是绘制一个力导向的网络图的例子。 36大数据(http://www.36dsj.com/)
我们可以通过d3treeR包绘制交互treemap图,利用
完成d3treeR包安装。
今天主要是介绍了几个R常用的交互包。在R的环境中,动态交互图形的优势在于能和knitr、shiny等框架整合在一起,能迅速建立一套可视化原型系统。
End.