GeneDock完成两项云平台合作，企业级应用渐成基因界网红

36 氪获悉，企业级基因数据云计算平台GeneDock（聚道科技）近期完成两项重要合作：

一项是 GeneDock 与中国疾病预防控制中心（中国 CDC）传染病预防控制所合作开发的微生物数据分析云平台（以下称 “云平台项目”）已于今日正式上线开放；

另一项是与iGeneTechTM签署战略合作协议，针对不同规模和属性的客户及多元化市场需求，采用基因检测产业化发展搭载互联网 + 平台实现全面信息化的方式，提出全新的服务。

可以看到，两项合作与应用均来自机构层面。这也显示出，在消费级市场面临用户认知瓶颈的背景下，企业级市场正开始率先成熟并加速成长。

①微生物数据分析云平台

云平台项目由中国疾控中心传染病预防控制所发起，主要是为了提升传染病领域大数据的利用效率，实现高通量测序技术在病原菌检测和监测工作中的标准化应用，让非专业人员也可以快速、准确、方便地开展生物信息分析，鉴定样本微生物的组成和基因组特征，并尽快开展后续的深入研究和信息挖掘。

“传染病防控领域与人类健康息息相关，对数据利用的时效有较高的要求，同时需要不同城市的部门和实验室之间实现数据共享和交互，以及标准化的数据分析流程，云计算为打通这些环节提供了可能性。” 传染病预防控制所项目负责人张雯说，“我们希望可以通过微生物分析平台的建设，促进国内疾控数据的交互，推动高通量测序技术在国内病原菌检测和监测工作中的有效利用。”

首期云平台项目发布了 6 个不同的生物信息分析流程，可实现 NGS 数据的质量控制、基因预测、进化分析、蛋白注释等功能。平台的 web 前端目前可支持至少 100 位用户同时并行操作，80 个分析作业的并行进行。弹性的平台设计支持未来对计算和存储资源的无限扩展。

值得关注的是，云平台项目开发过程中出现了一些预料之外的状况：例如，传统的数据存储和云平台存储方式具有较大差异；由于疾控领域信息的敏感性，对数据安全和用户账户权限的严格分级控制都具有很高的要求；实验室过去编写和部署流程没有比较统一的标准和环境等。针对这些问题，双方最终确定了如下系统架构：

“平台主要向 CDC 系统的各级科研和卫生防疫人员提供可视化的微生物数据分析流程。我们已经合作将微生物领域所需的基因数据分析流程迁移到平台上，包括传染病预防控制所专家们自主研发的最新算法和分析流程。GeneDock 的基因数据云服务在底层全面支撑这些重要业务。” GeneDock 首席技术官王乐珩说。

另据介绍，GeneDock 团队在云平台项目中应用的关键数据技术，包括在安全方面，平台在数据传输和存储过程中全面应用了数字签名、金融级加密等工业级技术；新设计的企业级母子账户权限系统，满足科研用户对珍贵基因数据的控制和分享需求；在数据传输方面，GeneDock 独有的基因数据压缩算法和传输系统，提高数据传输的效率；另外，GeneDock 提供了分析流程配置工具，方便生物信息学家研发新的分析流程。

②“英雄联盟”

早在iGeneTechTM 完成新一轮融资时，投资人周密就透露，iGenetechTM 与其之前在经纬创投主导投资的基因大数据 PaaS 公司-Genedock（聚道科技）也非常互补和协调，两家公司合起来能够为基于 NGS 的基因检测行业提供一条龙完整产业链服务。Genedock 把这次与 iGeneTechTM 的合作形容为 “英雄联盟”。

iGeneTechTM 专注于生物技术创新的平台型公司，以基因捕获技术为核心，致力于为行业内的企业、临床检验所及医院提供基因检测产品的设计、制造、测试及数据分析服务，同时致力于建立并推广企业及行业内生产与数据标准。GeneDock 则致力于用先进的数据技术加速基因检测的应用，为用户提供生物医药研发、组学科研及医学诊断等方面的云端生信流程优化、基因数据传输与分析、结果交付与安全管理等 BT+IT 信息技术服务。

双方这次合作主要是发挥各自特长，针对不同类型和规模的客户群体及市场需求，通过战略合作定义出新的服务与合作模式：

小型企业—基因检测项目整套解决方案

针对小型基因检测企业的业务特点，如检测体量有限、持续周期长、项目类型多等，iGeneTechTM 与 GeneDock 已合作完成从设计实验到结果云分析的整套解决方案体系的搭建。

目前，iGeneTechTM 已将所有相关标准生物信息分析流程部署在 GeneDock 云平台上（包括全外显子、液相杂交目标区域捕获、多重扩增子目标区域捕获等），通过进一步的流程优化和安全升级来实现云端全自动化基因数据分析、报告生成、存储管理与任务实时监控等功能，使得小型基因检测企业对基因大数据的传输、分析、存储及管理更加便捷与智能，实现了基因检测产品从设计、定制、检测到云端分析与管理一体化，形成了完备的整体解决方案体系。iGeneTechTM 已为十多家用户提供了完善的服务。

中型企业--模式克隆，建立信息化互通平台

针对具有相当检测规模、注重交付品质以及多为工业采购合作模式的中型企业，iGeneTechTM 与 GeneDock 采用 Case by Case 模式为其定制建立贯穿整个业务体系的信息化互通平台。一方面，客户可以在 iGeneTechTM 进行产品设计、定制和检测服务，在下游生物信息分析时接入 GeneDock 云分析平台，进行安全高效的数据分析与管理。另一方面，客户采购 iGeneTechTM 试剂盒之后，可直接克隆 iGeneTechTM 与 GeneDock 高效低成本的运转模式，对接自身信息化管理系统。

医院和临检所--检测常规化，重在数据与样本积累

针对一些三甲医院和临检机构，为满足其检测量大、检测周期要求短、样本与数据隐私安全要求高等核心需求， 双方提出全新的以仪器小型化和临检去中心化为目标的合作模式。

不同于现有任何仪器投放和送样检测的服务模式，这种新的合作模式包括从小型测序仪器投放 (如 Illumina Miniseq, life proton, 10× Genomics GemCode 等)、iGeneTechTM产品设计定制与试剂盒准备、GeneDock 私有云信息化管理的完整解决方案，解决客户以下三个主要痛点：

——高效率低成本搭建完整体系，如 Illumina Miniseq, life proton 和 10× Genomics GemCode 等小型测序平台检测与云端自动化标准流程分析可在三天内出具精准的检测报告，极大地提高临床检测效率，缩短交付周期；

——患者样本与数据均保存在医院本地，配合 GeneDock 提供的安全管理方案，更满足临床客户对数据安全的高要求，同时医院自身即可完成大量样本与数据的积累，方便进行后续的基因与临床大数据分析，随时发起多方合作，共同发掘数据价值并加以应用；

——一次性完成仪器投放和体系搭建，即可为用户提供长期有效的服务，使得临床检测常规化、去中心化。而极低的后期维护成本，更可以有效降低单位检测成本，最终使更多患者受益。