《核酸研究》发表我国微生物大数据平台建设研究成果

近日，中科院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心团队题为“World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbial strains worldwide”的研究论文被国际著名学术期刊《核酸研究》（SCI影响因子9.2）（Nucleic Acids Research）在线发表，微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心主任马俊才为本文通讯作者。

微生物作为最简单的生命体成为生命科学研究不可替代的基本材料， 微生物数据是微生物资源共享和开发的关键环节，数据资源的丰富性、准确性和共享水平决定着整个微生物学领域研究和应用的综合能力。世界微生物数据中心（World data center for microorganisms, WDCM,以下简称WDCM）隶属于国际生命科学联盟（IUBS）下属的世界微生物菌种保藏联合会(WFCC)和联合国教科文组织（UNESCO）下属的国际微生物资源中心（MIRCEN），由世界菌种保藏联盟在上世纪60年代建立，是全球微生物领域最重要的实物资源数据平台，也是我国生命科学领域唯一的一个世界数据中心。

在本研究中，团队以世界微生物数据中心（World data center for microorganisms, WDCM）为平台倡导全球微生物菌种保藏目录（Global Catalogue of Microorganisms，GCM）重大微生物数据资源国际合作计划，在为分散于全球各个保藏中心和科学家手中宝贵的微生物资源提供一个全球统一的数据仓库,并以统一数据门户的形式,对全世界科技界和产业界提供微生物菌种资源的信息服务。目前已经有来自美国、法国、德国、荷兰等43个国家和地区的107个国际微生物资源保藏机构正式参加这一计划。

在 大数据 整合技术研究方面，团队开发了生物资源引用平台系统，利用先进的数据挖掘手段，从全球超过600万已发表的微生物文献、专利、核酸序列和基因组中，进一步提取了微生物资源的后续研究和利用的信息，并开发了参考菌株目录，作为一个跨平台参考目录，整合ISO以及其他国际标准菌种统一编号，推动了全球菌种资源的高标准应用。该数据平台对于微生物实物资源从采集、保藏、跨国转移、学术和商业应用以及利益分享的各个环节都能提供有效的数据支持，为《名古屋议定书》在微生物领域的实施和执行提供最重要的支撑。平台及其相关的指导原则，是国际上第一次形成一套完善的可运行的信息平台方案。WDCM在CBD/NP实施方面的相关工作，也符合我国参与CBD工作的主要方向。

微生物大数据平台 目前已经处于稳定的运行和服务阶段，在数据集成和服务机制上，也进行了积极的探索，使得该平台能够有效地在全球范围进行数据资源的集成，并实现可持续发展。同时，WDCM作为一个合作平台，使我国科学家能够在全球的角度，组织和协调各国的相关力量，建立全球性的合作框架，也让中国有机会逐步在微生物资源的开发应用和数据共享方面占领国际微生物研究前沿和主导地位。截至目前，平台的累计访问次数已超过20万次。

本研究得到国家863计划《微生物数字化信息系统集成关键技术研发》、中国科学院信息化专项微生物领域云、中国科学院科技促进发展局《世界微生物数据中心建设》等项目的支持。

原文链接： http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2016/10/06/nar.gkw903.full?keytype=ref&ijkey=hg9qrQym7i5wgZN

马俊才，博士， 研究员，毕业于日本三重大学。现任中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心主任，世界微生物数据中心主任。世界菌种保藏联合会WFCC执委、国际科学数据委员会CODATA中国国家委员会委员、国际生命条形码项目iBOL全球数据镜像工作组主席、亚洲研究资源网络ANRRC数据工作组主席、国际微生物菌种数据网络MSDN委员、中科院科学数据库专家委员会副主任委员、中国科学院信息化专家委员会委员、中国科学院典型培养物委员会理事、科技部科学数据共享工程办公室成员、863计划“微生物数字化信息系统集成关键技术研发”项目首席科学家。先后获得中科院科技进步二等奖（第一作者）、中科院科技进步一等奖（第六作者）和国家科技进步二等奖（第六作者）。

主要从事于并行检索技术、超大规模全文检索技术、远程异构数据库的检索引擎技术、超级计算环境和超高速学术网络环境的综合利用等方面的研究，并从事微生物资源的信息化工作，主持中科院典型培养物委员会信息平台、中科院应用微生物研究网络信息平台、全国科学院联盟微生物分会信息平台、中国生物技术与生物产业信息平台的设计与开发。

目前主持国际微生物菌种资源目录国际合作计划（Global Catalogue of Microorganism, GCM），以统一数据门户的形式,对全世界科技界和产业界提供微生物菌种资源的信息服务，并举办数次世界微生物数据中心研讨会,邀请全世界专家共同探讨国际范围内生物多样性学科发展现状，在国际生物资源中心信息管理及全球信息网络建设与交流等方面具有丰富的经验。

责任编辑：王培