吉因加推出肿瘤cfDNA基线计划，用大数据挖掘推动精准医疗发展

肿瘤是目前困扰人类疾病领域的最大难题之一，肿瘤的发生发展经历一个长期的、分阶段、多基因突变的过程；从根本上讲，它是一个基因组疾病，肿瘤患者治疗过程中表现出的不同临床结果，都跟基因有密切关系；因此，通过基因检测技术全面、精准地了解患者的基因突变信息及发生发展动态变化情况，对肿瘤临床治疗有非常重要的价值。

吉因加专注肿瘤基因检测领域，2015年4月于北京创立，近期成功完成2亿元A轮融资。本轮投资由华大基因领投，火山石投资、松禾资本等共同投资，目的是启动cfDNA基线计划，建立中国人肿瘤基线数据库。cfDNA基线计划是一项临床研究计划，吉因加将为每一位参与者建立个人连续动态的基线数据，最终所有患者的数据都将进入到吉因加cfDNA基线数据库中，实现自己跟自己比，自己跟别人比，走对肿瘤决策每一步的选择。

基线计划执行中，吉因加自主研发的ER-seq技术提供了精准检测的技术保障。肿瘤患者的肿瘤细胞在破裂时，会释放DNA到血液中，即为循环肿瘤DNA（ctDNA）。检测血液中的ctDNA对肿瘤早筛、用药和预后具有重要临床指导意义，但有一个难点是血浆中ctDNA含量极低，并且二代测序背景噪声很高，肿瘤信号很容易完全淹没在背景噪声中。而ER-seq技术通过富集ctDNA以及降低背景噪声干扰，能很好解决这些难点，将高通量测序背景误差下降1000倍，实现超高测序深度下千分之一低频突变的高精准检出。

吉因加的基线数据累积基于临床服务开展。在给每一个患者提供服务时，吉因加不仅检测了满足目前临床需求的100多个已知的与肿瘤靶向药相关的基因，还检测了另外900多个未明确与肿瘤靶向药相关的肿瘤突变基因，为全面、系统的精准分析患者状况提供可能，奠定 大数据挖掘 分析的基础。这部分的基因检测，吉因加自掏成本，并且费用不菲，是目前临床服务需求部分的好几倍。

易鑫告诉36氪，目前行业主流是检测几个到一两百个肿瘤相关基因，以满足临床用药需求为主，但实际上，如何实现肿瘤动态监测，如何进行早期肿瘤术后评估、复发监测，如何最终走向早筛等，才是解决肿瘤问题的关键所在。吉因加通过检测1000余个基因，超越现有临床需求，转向全覆盖的肿瘤相关基因数据分析策略，从而实现可贯穿、更精准的肿瘤治疗，这便是吉因加cfDNA基线计划的目标。华大COO张凌表示，吉因加基线计划的大数据分析正是其区别于其他液体活检公司的一个亮点。

基因 大数据的分析 结果如何应用到临床治疗指导中，易鑫向36氪作了详细介绍。第一，在肿瘤早期，吉因加可通过检测血液是否含有ctDNA，实现肿瘤早筛。第二，在传统情况下，患者做完手术后，由于没有检测手段去评估肿瘤手术情况及是否存在微小转移等，因此一、二期手术后患者是否需要化疗药继续治疗很难确定，这造成了癌症复发问题。吉因加通过对手术后残留ctDNA的检测，可以为医生提供患者是否需要化疗药治疗的参考依据。第三，在肿瘤用药治疗中，传统方法是检测与靶向药相关的100个基因靶点，然后根据突变靶点使用对应靶向药。但该做法的局限性是，肿瘤在不断进化，不同时间的靶点基因突变情况不一样。

以肺癌患者为例，同是EGFR靶点突变，采用相同的EGFR靶向药治疗，获益时间却不一样，有的是3个月，有的是20个月，这说明不止是EGFR，问题还出现在其他基因上。吉因加通过研究1000余个基因，采用自主研发的mTBI算法及mClone定性定量分析技术，分析EGFR靶点基因在1000余个基因中的不同时间的不同占比情况。如果某段时间EGFR靶点基因占比很高，说明患者的大部分肿瘤细胞都含有这个靶点，那患者吃EGFR靶向药的获益时间将很长，相反如果占比低，那患者获益时间将很有限，并且吉因加还可以检测出占比高的其他靶点基因，从而为临床用药提供定性定量依据。通过这种对患者治疗过程的实时动态监测，吉因加能够为临床治疗方案的选择、不同治疗方式后的疗效评估、耐药后的应对治疗策略等提供临床决策参考依据。

不过，人与人之间的基因差异非常大，仅研究肿瘤患者的基因突变还远远不够。因此，吉因加又提出了健康人群的基线计划。目前，吉因加将陆续启动12条基线计划，包括常见的早晚期肺癌、乳腺癌、消化道肿瘤等。吉因加合作的医院主要是一二线城市的三甲医院，其积累的肿瘤样本和数据已超过6000例。不过，由于是连续的动态监测，每个患者需要至少3次基因检测，这样的花费成本过万，因此吉因加的基线计划可以说是一个突破亿元人民币的计划。

吉因加目前的团队规模接近200人，其创始团队成员大部分都曾任职于华大基因。关于与华大基因的合作，易鑫表示，一个重要的合作方向是测序仪的技术优化合作，他希望测序仪能更准、更快、更便宜，从而吸引更多人参与肿瘤基因检测，获取更多数据。据了解，基因测序公司Illumina也曾在2016年1月组建新公司Grail，Gail利用Illumina测序仪，致力于研发早期癌症筛查的液体活检技术。华大基因COO张凌称，华大基因的CEO尹烨直接加入了吉因加的董事会，未来华大和吉因加将展开全方位、战略性的合作。同时，华大基因致力于打造NGS产业生态圈，将与产业链众多优秀公司展开各种不同形式的合作。

作者：大姿，转自：36kr.com/p/5052425.html

责任编辑：王培