华为云CCI全方位支撑基因检测核心技术
中国每年有1400万新生儿、300万新发肿瘤患者。意味着每5个家庭迎来新添成员的喜悦,就有一个家庭陷入可能失去亲人的悲痛。每一天,都有8000+人失去健康。
如果可以早知道、早预防、早治疗; 如果我们有一份报告,告诉我们可能在自己身上发生的病变;如果我们可以赶在时间前面、赶在疾病前面……这听起来是不是有点科幻?
2017年,我国发改委明确了基因检测能力覆盖50%以上出生人口的目标,利用基因测序等高 科技 手段,在胎儿罕见病筛查、肿瘤、遗传性疾病等方面实现精准的预防和诊治。通过对血液、体液、细胞或DNA通过基因测序等技术手段进行检测,分析是否含有潜在高风险疾病可能性,以及表达功能是否正常。
更多的疾病将依赖基因检测结果作为主要信息作出诊疗判断,基因检测技术也为精准治疗药物的创新开发,减少无效和过度医疗、避免有害医疗、遏制医疗费用过度支出等提供大数据平台支撑。
在基因检测技术中,工具碎片化、开发语言多样、系统维护和升级等技术难题一直在制约行业的快速发展。容器技术因为标准化封装保证环境一致性、秒级扩缩容、高资源利用率的特点逐渐作为支撑基因检测的核心技术。
在这一场推动人类繁荣发展的浪潮中,上海其明信息技术有限公司就是其中之一,通过先进的云计算技术为医疗用户提供更高效诊断,更科学化的建议,所开发的基因检测与基因云计算的GCBI综合平台被广大医疗及科研院所接受。华为云容器实例(Cloud Container Instance)服务(以下简称华为云CCI),以高安全、高性能、低成本、简单易用的优点作为GCBI的底层核心技术支撑,帮助GCBI平台服务于基因检测行业。
基因检测挑战诸多 华为云CCI多方位承载GCBI核心业务
华为云CCI在2018年3月推出公测,也是全球首个基于K8S的商用serverless容器服务,在多方面满足了其明公司的需要:
华为云CCI目前采用Kata安全容器技术,将虚拟机成熟的隔离技术应用到容器领域,确保客户业务和数据的安全。
1、按需按秒计费很有必要,节省成本可达 50%
基因测序公司在承接用户业务时,通常是在样品累积够一定量的时候进行批量处理,这就意味着原始数据来源具有周期性,业务波动性较大。为了保证对医疗及科研客户的交付,其明公司通常是按照最大的业务量来维护虚机规模,但是这些资源在相当一段时间内处于闲置状态,造成极大的浪费。
华为云CCI按需按秒计费的功能妥善的解决了这一难题,解决了其明公司业务波动性带来的资源浪费以及成本难问题。经过上海其明公司信息技术有限公司仔细测算, 按需按秒计费比包年包月节省成本高达50%。
2、从 20 分钟提升为秒级并发,华为云 CCI 功不可没
在基因测序的市场中,几乎所有的公司都会面临这样的问题:基因测序以及测序结果的解析需要较长时间,用户无法实时拿到实验结果,便会产生不信任的心理,会对新事物产生质疑
其明公司也不例外,每个样品需要8核至32核容器实例进行计算,后台需要高并发的计算量在两小时内反馈结果,以保证其对客户的SLA。然而每次启动虚机,集群和节点纳管、业务上线时间就需要近20分钟,即使是业务扩容,也需要耗费10多分钟。
华为云CCI秒级伸缩和高并发的特性针对这一问题做出了极大改善,kata容器启动速度实测600毫秒,集群规模高达上十万容器实例, 其明公司GCBI平台在使用华为云CCI服务 后,业务 上线时间从20分钟降为秒级并发,大大提升效率, 不会再为满足客户SLA感到担心。
3、运维 简化 后 , 省心省力 省钱 ,只需专注业务。
在使用华为云CCI之前,其明公司在自己的公有云虚机资源内纳管了一个小型的K8S集群,并积累了大量的实战经验,即便如此,对硬件资源和K8S集群的运维依然是件头疼的事,需要考虑集群的升级、社区bug修复、集群资源利用率等问题,消耗着公司大量资源。
华为云CCI将serverless理念引入到容器领域, 可以直接购买和管理容器实例 ,无需管理物理资源和K8S集群,同时,华为云CCI提供了 可视化 的pod CPU/MEM监控功能,可以 实时监控处理过程,极大的简化运维成本 ,让上海其明公司信息技术有限公司可以专注自己的业务。
其明公司开发总监蔡家华表示:“通过将自己的业务部署在华为云CCI上,实际计算成本降低30%-50%,并且实现了K8S和物理资源免运维。其明公司非常高兴华为云CCI可以帮助自己实现一系列成本的降低,提升客户SLA的服务标准,让自己可以更聚焦业务和客户。”
有华为云助力,其明公司基因检测与基因云计算的综合平台GCBI已完成25万例基因数据分析和挖掘、协助作出1万多次基于基因信息的临床决策,参与8万余个疾病相关基因临床信息挖掘研究项目。
人工智能也好,基因检测也罢,好的技术应该用来帮助更多的人。将至已至,未来已来,3月21日,华为中国生态伙伴大会,我们并肩同行,福州见。