【首发】构建智能化基因数据解析平台,赛福基因获千万元天使投资
【猎云网(微信号: ilieyun )北京】10月16日报道(文/竹子)
精准医疗是一个庞大的市场。 近年来,精准医疗逐渐从学术研究走向临床应用,越来越多的人开始接受基因检测技术。
总部位于中关村的赛福基因成立于2015年10月,是一家精准医疗服务提供商,致力于用基因科技提高临床诊断准确率和患者治愈率, 同时为关注健康的客户群体,绘制个体基因组信息图,提供个性化的健康建议。最终目标是让每个人拥有一本基因使用说明书。
今年2月,赛福基因完成了天使投资,拿到了创见资本、将门基金以及朗玛峰创投三家机构的千万元级天使投资。
赛福基因创始人余伟师
3年前,余伟师通过美国博士人才创业平台,会聚了64名技术人员。大部分成员来自哈佛大学、耶鲁大学、美国国立卫生研究院(NIH)、MD安德森癌症研究所等多家美国著名院校和医学研究机构。
他们基于美国的既有基因开放数据库,对上万种疾病的基因信息进行整理和校正,拥有了一个更全面和准确的基因数据库。 同时, 团队在引入分析数千例中国疾病基因数据后,搭建起了一个基于中国人的基因数据库。
“世界不同的人种虽然有差异,但整体上不超过1%的基因差异,大部分美国的基因数据信息可以应用于中国人,前提是需要结合完整的临床信息,形成一个可使用的中国人基因数据库。”余伟师说。
怀揣着推动中国精准医疗事业发展的梦想,余伟师在2015年带着团队回国创办了赛福基因,并入驻微软创投加速器。
推动智能化基因数据解析
赛福基因基于全基因的基因检测手段,研发了一系列针对患者(癌症、癫痫等)的个性化诊疗解决方案。
平台用智能化方式构建基因数据解析平台,实现基因解析的自动化、批量化和个性化,提高基因数据的解析准确度和速度。
根据赛福基因官方提供的数据显示,相比目前行业内的人工分析,智能化模式最高可提升了20-50倍的解析速度。同时,实现致病性变异预测的误差率降低了19%,精确度提高了50%。
赛福基因今天正式推出了基因数据智能解析平台“清Clear”,以及精准医疗系产品“晶Crystal”系列,推动中国的全基因数据解析工具和癫痫精准诊断治疗 的突破。
清平台通过整合癌症与基因、药物与基因、疾病与基因三大数据库,实现基因突变的快速检出、深度注释和垂直解读,结合多维度的遗传信息及临床数据,生成易读的生物临床交互报告。具有“快速、准确、稳定和可重复”四大特点。
清平台最终的功能将会实现集医学大数据存储、计算、分析、解读功能于一体的人工智能精准医疗服务体系。
余伟师透露说,赛福基因通过自动化和智能化等技术手段,把基因数据的分析解读成本降低了50%。目前清平台主要是赛福基因内部使用,成熟后会首先开放给企业客户使用,比如医院和第三方检验机构。随着平台交互,数据传输等其他功能的进一步完善,清平台未来将直接让开放给个人用户使用。
基于清平台,赛福基因推出了“晶”系列产品,包括针对癫痫患者的“安晶”、针对癌症临床研究的“元晶”,以及针对健康人群的“全晶”。
安晶
癫痫是继癌症之后最有可能实现精准医疗的病种。“安晶”将全基因测序技术应用于癫痫辅助诊疗,开创了癫痫个体化诊疗新模式。
全基因测序技术能检测出已知癫痫致病基因的位点,还能检出癫痫患者高发生率的原发性未知突变,让癫痫致病性基因突变阳性检出率提高了50%,帮助医生对癫痫致病机理更深入全面的了解。
元晶
“元晶”整合基因组学,从癌症基因组数据出发,结合患者的家族史、发病史、以及影像与数字病理诊断等临床信息,致力于对现有检测、治疗和药物相关产品的升级方案研究,是一个针对癌症的临床研究和临床转化而开发的产品。
全晶
“全晶”主要面向大众健康管理需求。客户向赛福基因提交自身个性化的需求并购买相关检测产品服务,样本采集后,30-40天后,客户就能得到一份基因分析的健康管理报告。
对客户来说,赛福基因的报告针对12个系统的多种疾病风险,提出有针对性的方案,让客户尽早调整自己的生活方式,进行科学预防。同时还可以对客户提出运动与营养方面的相关指导,进行运动和体重方面的管理。
对患者来说,报告可以出具精准化的诊疗措施,提出个性化的用药信息,来避免药物不良反应、药物浪费和耽误治疗时机。
报告还能辅助医生快速确诊病因,精简诊断程序。同时,帮助医生优化诊断方法。
组建跨过团队,用技术降低成本
基因数据分析的关键是数据的解析能力,而数据解析的关键又在于跨学科的队伍组建。 余伟师的团队便是一个跨界团队,有来自各领域的技术和学术型人才。
本人是美国国立卫生研究院国家癌症研究所的科学家,拥有12年在癌症与疾病基因组学、干细胞和再生医学领域丰富的研究经验,积累了对癌症与疾病诊疗行业的深厚理解。
,美国耶鲁大学应用数学博士,美国爱荷华大学精神科系研究科学家。拥有11年在疾病基因组学分析领域的资深经验,研究领域包括生物信息学,统计遗传学,数学统计建模以及快速算法等。
是俄亥俄州立大学生物医学博士,俄亥俄州立大学综合癌症研究中心科学家。拥有16年在癌症基因组学、生物信息学以及发育生物学领域的丰富经验。
是美国南加州大学病理生物学博士,美国西奈山伊坎医学院Tisch肿瘤研究所博士后。拥有8年在前列腺癌研究领域的研究经验。
目前市场上的基因检测公司的临床产品,普遍采用基因芯片和基因包(gene panel)的检测技术。这两种方法的缺点是,只能覆盖已知的基因信息。而全基因数据分析,获取的是两万个基因的数据。因此,数据分析更加全面、精准。
基因数据分析行业,之所以多年来一直发展缓慢,主要是全基因测序的成本过高,中国人基因数据库的匮乏,以及全基因数据分析存在的技术瓶颈。
全基因组测序成本,从十几年前的几十亿美元大幅下降到目前的一千美元左右,不难推测,全基因组测序未来几年会走入我们每一个家庭。
虽然全基因测序成本降低了,但在中国,基因数据库的构建才刚刚开始,基因数据库中,与疾病相关的基因突变信息很少,能直接指导临床治疗的信息更少。如何完善中国人的基因数据库,并低成本地实现全基因数据分析,是基因医疗行业多年来一直难以逾越的一道坎。
余伟师透露说,赛福基因的基因数据库是在混合云平台上搭建的,具备自动化、可视化、批量化特点,这些技术手段让基因数据的解析成本降低了50%。
赛福基因平台希望打通医院、第三方检测机构、科研院所和药企等产业相关方,形成一个基因数据共享和精准医疗协作平台。
目前赛福基因已经与美国克利夫兰医学中心(Cleveland Clinic)、俄亥俄州立大学医学院、美国国立卫生研究院(NIH)、北京大学肿瘤医院、北京协和医院、上海东方肝胆医院、第四军医大学唐都医院、中南大学湘雅医院等30余家国内外著名医疗科研单位,以及诺禾致源、药明康德、吉因加、海普洛斯等国内知名第三方检测机构在产品研发、生产应用及市场推广等方向开展深入地合作。
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